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src/wp-includes/ms-functions.php

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         populate_roles();
         $wp_roles->_init();
 
-        $url = untrailingslashit( $url );
+        $siteurl = $home = untrailingslashit( $url );
 
-        update_option( 'siteurl', $url );
-        update_option( 'home', $url );
+        if ( is_https( get_site_option( 'siteurl' ) ) ) {
+                $siteurl = set_url_scheme( $siteurl, 'https' );
+        }
+        if ( is_https( get_site_option( 'home' ) ) ) {
+                $home = set_url_scheme( $home, 'https' );
+        }
+
+        update_option( 'siteurl', $siteurl );
+        update_option( 'home', $home );
 
         if ( get_site_option( 'ms_files_rewriting' ) )
                 update_option( 'upload_path', UPLOADBLOGSDIR . "/$blog_id/files" );